Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms