Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde1Q9DBZ9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms