Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Riok3Q9DBU3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms