Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms