Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrmuQ9DAT5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TrmuQ9DAT5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrmuQ9DAT5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrmuQ9DAT5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrmuQ9DAT5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrmuQ9DAT5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrmuQ9DAT5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms