Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018B08RikQ9DA83 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms