Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8N1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8N1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms