Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpl4Q9D8E6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl4Q9D8E6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms