Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp5Q9D7S9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms