Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2dQ9D7M8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms