Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm5Q9D7I9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tgm5Q9D7I9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm5Q9D7I9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms