Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cldn23Q9D7D7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cldn23Q9D7D7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn23Q9D7D7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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