Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpap3Q9D706 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms