Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
2900055J20RikQ9D6G3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2900055J20RikQ9D6G3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2900055J20RikQ9D6G3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2900055J20RikQ9D6G3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2900055J20RikQ9D6G3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2900055J20RikQ9D6G3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2900055J20RikQ9D6G3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2900055J20RikQ9D6G3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2900055J20RikQ9D6G3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms