Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms