Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms