Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ShpkQ9D5J6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShpkQ9D5J6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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