Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms