Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms