Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms