Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930578G10RikQ9D4Q4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms