Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh2Q9D489 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms