Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UvssaQ9D479 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UvssaQ9D479 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms