Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odf2lQ9D478 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2lQ9D478 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms