Protein–RNA interactions for Protein: Q9D413

Sh2d6, SH2 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d6Q9D413 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d6Q9D413 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d6Q9D413 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms