Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms