Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stag1Q9D3E6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms