Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms