Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms