Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms