Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ss18l2Q9D174 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ss18l2Q9D174 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ss18l2Q9D174 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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