Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc3Q9D114 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms