Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snu13Q9D0T1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms