Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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