Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx17Q9D0I4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx17Q9D0I4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms