Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid3bQ9CYY7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid3bQ9CYY7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid3bQ9CYY7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid3bQ9CYY7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid3bQ9CYY7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid3bQ9CYY7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid3bQ9CYY7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid3bQ9CYY7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid3bQ9CYY7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid3bQ9CYY7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms