Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms