Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx7Q9CY18 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx7Q9CY18 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx7Q9CY18 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms