Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdhdQ9CXV1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdhdQ9CXV1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms