Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed5Q9CXE7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms