Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms