Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms