Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a2Q9CTG6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms