Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRW3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRW3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRW3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRW3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRW3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRW3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRW3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms