Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ska2Q9CR46 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms