Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PclafQ9CQX4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms