Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQM1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQM1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQM1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQM1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQM1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms