Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms