Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQF4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms