Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms